爱沙尼亚政府已决定结束对欧盟内部边界和申根地区的边境管制。然而，对行动自由的限制(即如果来自感染程度较高的国家，是否必须在过境时隔离14天)的适用，仍在国内边界适用。

从5月11日起，爱沙尼亚境内所有购物中心将恢复开放，包括购物中心内的所有服务型商店和餐饮店。为了避免晚上在餐厅、咖啡馆和酒吧聚集的人群，餐饮业必须在晚上10点结束营业。 

当5月14日恢复爱沙尼亚和芬兰之间的往返通勤时，从芬兰抵达的人员将在船上接受冠状病毒检测。

爱沙尼亚金融服务管理局（FSA）警告投资者，Unitedbulltraders OU公司没有从事投资服务的许可证，因此无权在爱沙尼亚提供投资服务。

爱沙尼亚社会事务部长基克表示，虽然爱沙尼亚尚未确定结束紧急状态的做法，但在夏季结束前限制措施只会逐渐放宽。